Nyborg Kirke - eller Vor Frue Kirke, som den egentlig hedder - blev bygget i årene 1388-1428 og blev indviet til Jesu mor, Maria, pinsedag 1428.Ældst er kirkens fire vestlige fag, som i begyndelsen af 1400-årene var afsluttet mod øst af en nord-syd-gående mur. Inden 1428 var kirken forøget med de to østligste fag, kirkens nuværende kor, og - formodentlig - tre tilbyggede kapeller.Omkring Reformationen var der opført tre sammenbyggede kapeller med et fælles tag på kirkens sydside, og Christian den 3. lod i 1550'erne kirken udvide med et ekstra sideskib mod nord i kirkens fulde længde. Det store vesttårn og det lille østtårn stod færdige omkr. år 1600. Vor Frue Kirke fremtrådte som en 5-skibet kirke frem til 1870. I 1870-71 blev store dele af sideskibene nedrevet under ledelse af arkitekt Tvede. Derved fik kirken sit nuværende ydre udseende. Kirkens orgeler bygget i 1973 af orgelbygmester Poul-Gerhard Andersen, København. Orglet har 36 registre, fordelt på 3 manualer og pedal. Det har mekanisk traktur og registratur samt sløjfevindlader. 4 af registrene er overflyttet fra et tidligere Demantorgel (1834), og 3 registre antages at stamme fra kirkens første orgel, bygget af Hans Brebus i 1596. Orglet rummer ca. 2400 piber.Kirken er tilgængelig for publikum af søndre dør. Klokkespil kl. 8.00, 12.00, 16.00 og 22.00.