Trinitatis Kirke blev indviet i 1656 som kirke for universitetets professorer og studerende, men er i dag almindelig sognekirke. Navnet henviser til Treenigheden – Gud, Søn og Helligånd – men også bygningskomplekset var oprindelig en treenighed af kirke, observatorium og universitetsbibliotek. Kirkens indre blev hårdt medtaget ved Københavns brand i 1728 og bærer i dag præg af genopbygningen i 1731. Kirken rummer feltmarskal Hans Schacks gravmonument i marmor, mens digterne Johannes Ewald og Johan Herman Wessel ligger på den nu sløjfede kirkegård. Der er gudstjeneste hver søndag klokken 10.30, og desuden foregår der en række andre begivenheder i kirken, blandt andet studentergudstjeneste og natkirke. Se hjemmesiden for åbningstider.